BIOSIS Previews (BP)
BP简介(1)——收录情况
BP的特点:
1. 提供综合全面的生命科学信息资源,包括:
Biological Abstracts (BA,世界上最权威的生物学信息检索工具之一)
Biological Abstracts/RRM (BA/RRM, Reports, Reviews, and Meetings,专门用于检索报告,综述和会议信息)
BioResearch Index
BP简介(2)——收录情况
来自90多个国家出版的 5,000 多种生物学和生命科学的期刊,及相关的国际会议,综述,书籍和专利信息(主要是美国专利).
其中约2100 生物学和生命科学的出版物为完全收录的,另外3000 种出版物只收录其中有关生命科学的内容.
BP简介(3)——收录情况
内容每周更新,更新条目达一万多条.
可回溯至1969年,包含1300多万条记录.
目前我馆可回溯至1996年.
覆盖所有生命科学的领域,包括:生物化学,生物工程学,遗传学,生物学,植物学,动物学,临床和实验医学,药理学,营养学,农学和兽医学.
BP简介(4)——文献来源
BP简介(5)——检索途径
2. 检索方便快捷,功能强大,提供多个检索入口:
主题(Topic,基于自然语言)
学科(Major Concepts,主要概念)——BP特有
生物分类(Super Taxa)——BP特有
著者(Author)
专利权人(Patent Assignee)
专利号(Patent Number)
来源出版物(Source Publication)
会议信息(Meeting Info)
地址(Address)
BP简介(6)——检索平台
3.基于ISI Web of Knowledge平台
友好的Web检索界面
与ISI(美国科学情报研究所)的其他多种出版物建立动态链接,实现跨学科,跨数据库的交叉检索.
目前BP可以与ISI Web of Science (SCI),ISI Proceedings (ISI的会议录)实现跨库的交叉检索.
ISI属于Thomson Corporation集团,总部在美国费城(ISI的网址:
http://www.isinet.com)
Thomson Corporation集团是全球商业和专业市场中提供信息资源及信息服务解决方案最领先的公司之一.
登录BP
BP的网址:
http://biosispreviews.isihost.com/校园网——北校区图书馆——信息资源————网络数据库——Biosis Previews
只能在中山大学的IP范围内使用
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BIOSIS Previews主页
BP的全记录格式及主要字段
BP的主要字段(1)
Title, Author, Address, Abstract, Journal or Book Title (刊名或书名), Source Information (来源信息,如年,卷,期,页码), Document Type (文献类型), Language, Publisher, ISSN/ISBN 等常用字段.
BIOSIS Accession Number(数据库的文献流水号)
Book Editor(图书编者)
Meeting Information(会议信息):
例如:30th Annual Meeting of the American Society of Nephrology
San Antonio, Texas, USA
November 2-5, 1997
American Society of Nephrology
BP的主要字段(2)
Major Concepts* (学科):一般为较大范围的学科分类,如Infection; Parasitology; Pharmacology等
Super Taxa* (上位生物分类):生物分类名(包括微生物),一般为较高级别的生物分类名称.例如:
Muridae: Rodentia, Mammalia, Vertebrata, Chordata, Animalia [鼠科:啮牙目,哺乳动物,脊索动物亚门,脊索动物门,动物]; Serpentes: Reptilia, Vertebrata, Chordata, Animalia [蛇类:爬虫纲,脊索动物亚门,脊索动物门,动物]
Taxa Notes * (分类说明):文献中出现的生物体(包括微生物)的常用名称(一般是上位词). 例如: Nonhuman Vertebrates; Reptiles; Rodents; Vertebrates
BP的主要字段(3)
Organisms * (生物体):一般为生物体的正式学名及常用名,较高一级的学科分类,细胞株等. 例如: Agkistrodon acutus (Serpentes) [尖吻蝮蛇(蛇类)]; rat (Muridae): animal model [鼠(鼠科):动物模型]
Parts, Structures & Systems of Organisms* (生物体的局部,结构和系统):一般从大分子水平揭示上述生物体的组成.例如:liver: digestive system; lung: respiratory system; carotid artery: circulatory system
Diseases* (疾病):人,动物,植物的疾病名称的描述.例如: thrombosis: vascular disease
BP的主要字段(4)
Chemicals & Biochemicals * (化学物质和生化物质):对文献中涉及的化学物质和生化物质的说明.例如:Agkistrodon acutus venom (尖吻蝮蛇蛇毒); F-II-a: fibrinolytic enzyme, thrombolysis effect, venom constituent (F-II-a: 纤维蛋白溶解酶,血栓溶解作用,蛇毒组分);
CAS Registry Numbers(CAS化合物登记号) :文献中涉及的化学物质的登记号(美国化学文摘社给化学物质的唯一号码). 例如:9001-90-5: PLASMIN
Sequence Data* (序列数据):文献中涉及的分子序列数据在基因库(GenBank)的编号.例如:B2123: amino acid sequence; B7632: amino acid sequence;
BP的主要字段(5)
Methods & Equipment (方法和仪器):例如:Western blot: detection method, detection/labeling techniques
Miscellaneous Descriptors (其他描述符):BIOSIS给文献标引的其他主题词(关键词). 例如: hemorrhage; thrombolysis
Alternate Indexing (替代索引):文献中涉及的其他索引词,如MeSH主题词.例如:Thrombosis (MeSH)
其他字段:如 Time, Industry, Persons, Institutions & Organizations*, Geopolical Location*等
注意:上述带*的字段为受控词汇,BP网站提供与这些字段有关的受控词表
BP的检索规则(1)
检索词不分大小写
可直接输入单词或短语,但不能包含标点符号
"-"默认为空格,如输入"IL 2"可检出IL-2及IL 2,输入"IL-2"也可检出IL-2及IL 2,但均不能检出IL2
支持截词"*"," "及布尔逻辑运算符AND,OR,NOT
支持邻近算符SAME
BP的检索规则(2)——截词
= 一个字符 * = 零或多个字符
右侧截断
词间截断 (通配符)
Diseas*
Disease
Diseases
Diseased
_
Lap*roscop*
Laparoscopic
Laproscopic
Laparoscopy
Gene*
Gene
Genes
General
Generation
_
Sul*uri ation
Sulfurization
Sulfurisation
Sulphurization
Sulphurisation
Pharmac*
Pharmacy Pharmacology
Pharmaceutics
Pharmaceutical
Neuros s
Neurosis
Neuroses
BP的检索规则(3)——布尔逻辑运算符
布尔运算符
_
_
TOPIC: biosurfactant* AND food industry
找到的文献必须包括 biosurfactant* and food industry.
_
_
_
当有词的变体或同义词时使用_
TOPIC: lycopersicon esculentum OR tomato
找到的文献至少包含一个检索词.
_
_
_
TOPIC: lactobacillus NOT acidoph*
找到的文献包含, 但不包含acidoph*.
_
BP的检索规则(4)——邻近算符SAME
默认状态下,输入两个检索词,系统作为词组进行检索.
用SAME运算符,要求两个检索词必须出现在同一个句子里,但在句子中的顺序是任意的.
在Topic检索中:
apopto* same gene*
在Address检索中:
aventis same bridgewater
可检索到的记录为:
Address: Aventis Pharmaceuticals, Inc, Route 202-206, Bridgewater, NJ, 08807, USA.
BP的检索规则(5) ——邻近算符SAME
使用邻近算符SAME能在扩大检索范围的同时,提高查准率.
除了Title和Abstract这两个字段外,邻近算符SAME所要求的"两个检索词出现在同一个句子(Sentence)"在下列字段检索时则要求"两个检索词是一个分号(;)里的内容".
包括:Organisms,Major Concepts, Super Taxa, Taxa Notes,Parts, Structures, & Systems of Organisms, Diseases, Chemicals & Biochemicals, Registry Numbers, Sequence Data, Methods & Equipment, Alternate Indexing, Miscellaneous Descriptors 等
上述示例中,其中一个生物体是"human".对这个词的修饰词是Tanzanian, Child, Patient.如果要检索有关Tanzanian儿童疟疾治疗方面的文献,可以用SAME写出检索式为:
Topic: Plasmodium falciparum and (child* same tanzania*)
"Sentences" 在这些项目中是指分号间的内容
修饰词列在主词的后面,修饰词间用逗号分隔.
BP的检索规则(6)
运算符的优先顺序为
( )>SAME>NOT>AND>OR
当使用多个运算符时可用括号决定优先顺序.在一个检索提问中最多可使用50个运算符.
BP的检索步骤
进入检索主菜单,选择检索年份;
选择检索入口(可多个检索途径组合);
输入检索表达式(检索词及其逻辑组配关系);
(BP不提供二次检索,也不提供如同Medline的检索过程列表或多次进行逻辑组配检索,因此检索BP要求先制订检索策略,一次性输入检索式)
进行语种,文献类型或生物体的限定,设定检索结果的排序方式;
如果检索策略比较复杂,可选择保存检索策略;
点击Search进行检索;
浏览并标记检索结果(Summary及Full Record);
检索结果的打印,存盘或 E-mail发送.
主菜单及年份选择
主菜单及年份选择
BP的检索途径——TOPIC检索(1)
TOPIC检索(主题检索)是最常用的检索途径.
BP采用relational indexing(相关索引)技术,提供基于自然语言的索引机制.
点击Title Only则限定检索词只出现在标题.
TOPIC检索时,输入检索式后,系统将自动对多个字段同时进行检索.
BP的检索途径——TOPIC检索(2)
检索示例:蛇毒纤维蛋白溶解酶的克隆表达及分离纯化
检索策略:采用TOPIC检索,检索表达式为: TOPIC=venom* AND (fibrinolytic enzyme* OR thrombolytic therapy) AND (purificat* OR clon*)
注意:要求在检索框中一次性输入检索表达式,可用各种运算符号
BP的检索途径——TOPIC检索(3)
BP的检索途径——MAJOR CONCEPTS检索
应用Major Concepts检索时,一般可输入学科名称进行相关领域的大范围检索.
Major Concepts为受控字段检索,点击List可浏览Major Concepts的内容(包括按字顺排列及按学科排列两种方式),复制粘贴感兴趣的Major Concepts并进行检索.
在TOPIC检索时已经自动进行Major Concepts检索.
Major Concepts检索与TOPIC检索可组合使用,以提高查准率.
例如:检索蛇毒的毒理学方面的研究内容,可用Topic检索与Major Concepts检索进行组合.
检索蛇毒药理学方面的研究内容(组合检索)
BP的检索途径——SUPER TAXA检索
应用Super Taxa检索时,一般输入生物分类名称进行检索.
注意应尽量使用较高级别的分类名称,以扩大检索范围,保证查全率.
Super Taxa为受控字段检索,点击List可浏览点击Super Taxa 名称.
在TOPIC检索时已经自动进行Super Taxa检索.
Super Taxa也可与TOPIC检索可组合使用,以提高查准率.
组合检索示例:腺病毒与肿瘤的基因疗法
组合检索示例:宫颈癌与单纯疱疹病毒感染
BP的检索途径——AUTHOR检索
著者检索时可输入多位作者的名字(100个).
检索时姓用全称,名字可用缩写或全称.
为防漏检,可采用姓用全称,名字首字母后加"*"进行检索,同时结合其他检索途径提高查准率.
注意:BP的记录中,著者字段一般姓与名之间用"," 再加空格分隔,且姓及首名字用全称.
中国人的姓名表达方式经常出错,检索时应小心.
示例:Smith Alison M 可检出 Smith, Alison M.
Smith Alison 可检出Smith, Alison.
Smith Alison* 可检出Smith, Alison
Smith, Alison D.
Smith, Alison M, 等等.
著者检索示例:检索颜光美(Yan Guangmei)教授的论文被BP收录情况
作者检索结果
BP的检索途径——PATENT ASSIGNEE及PATENT NUMBER检索
PATENT ASSIGNEE检索:输入专利权人的名称(可以是个人,也可以是机构)进行检索.
如果专利权人是机构,应注意机构的不同表达方式
PATENT NUMBER检索:输入专利号进行检索.
注意:BP仅收录了1995-1999年的美国专利
示例:检索诺华公司的专利
专利检索结果——概要(Summary)
专利检索结果——全记录格式(Full Record)
专利检索结果——全记录格式(Full Record)
BP的其他检索途径(1)
(1)SOURCE PUBLICATION(来源出版物检索)
主要用于检索某一刊物或图书是否被BP收录
检索时必须正确输入刊名的全称,如果输入刊名缩写,一般应使用截词,以防漏检.
点击List可浏览BP收录的所有来源出版物,了解某一刊物是否被BP所收录,帮助正确选择刊名.
检索书名时一般与TOPIC检索组合,或使用SAME邻近算符
点击List可浏览按字顺排列的BP的来源出版物的全称
示例:检索Anticancer Research被BP收录的文献
来源出版物检索结果
BP的其他检索途径(2)
(2)MEETING INFO(会议信息检索)
可输入会议名称,会议主办地点,会议主办者和会议日期等信息,并用AND或SAME连接.
如果要检索某一篇特定的会议论文,可采用组合检索,如TOPIC检索与MEETING INFO检索组合,AUTHOR检索与MEETING INFO检索组合,以提高查准率.
示例:查找1997年召开的美国第30届肾脏病学年会的会议文献(30th Annual Meeting of the American Society of Nephrology, San Antonio, Texas, USA,
November 2-5, 1997, American Society of Nephrology
检索信息检索结果
会议论文信息
示例:查找1997年召开的美国第30届肾脏病学年会上有关肾移植的文献
BP的其他检索途径(3)
(3) ADDRESS(作者地址检索)
可直接输入作者地址
作者地址常采用截词方式
可使用邻近算符SAME,以提高查准率
示例:检索中山医科大学发表的论文被BP收录情况
检索结果
检索结果的限定及排序方式选择
点击Set limits and sort options,可对检索结果及排序方式进行限定.
检索结果的限定包括
语种 (Language)
文献类型 (Document Types)
生物体 (Organisms)
检索结果的浏览和标记(1)
检索结果的两种浏览方式为Summary(概要)和Full record(全记录)
Summary包含了文献的题录信息,包括作者,篇名,来源.
在Summary浏览文献时,标记记录(Marked List)的方式有两种:
(1)点击记录左边的标记盒,然后点击Submit按钮
(2)选择Mark All标记所有记录(最多500条)
点击Submit后,页面上方出现Marked List标记,点击可浏览选中的信息
检索结果的浏览和标记(2)
Full record给出了每一条记录的全部信息
如果购买了Web of Science,则可以在Full record页面与Cited reference, Citing reference及Related records建立动态链接
标记记录列表
检索结果的输出
检索结果的输出方式包括:
打印记录:可选择要打印的字段
保存记录:将选中的记录保存
将记录输出到文献信息管理软件
电子邮件传递
订购全文
检索策略保存
如果检索策略比较复杂,可将检索策略保存到磁盘中,以便今后检索时使用
保存检索策略
运行已保存的检索策略
BP的帮助系统
BP总结
BP与Medline,PubMed的对比
BP作业
1,查找有关人的肺癌基因芯片的英文文献.
(基因芯片:microarray OR gene chip)
2,查找2002年发表的有关妊娠巨细胞病毒感染文献.
(巨细胞病毒cytomegalovirus,属于Herpesviridae病毒科)
3,查找2002年9月在匈牙利布达佩斯召开的欧洲糖尿病研究协会第38届年会有关糖尿病性高血压的会议文献.
( 38th Annual Meeting of the European Association for the Study of Diabetes (EASD)
Budapest, Hungary
September 01-05, 2002
European Association for the Study of Diabetes)
以上作业,要求写出检索策略,每题摘录1条检索结果的题录(包括篇名,作者,出处)